Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCRBV7S3A2A0A539 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCRBV7S3A2A0A539 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCRBV7S3A2A0A539 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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TCRBV7S3A2A0A539 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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TCRBV7S3A2A0A539 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TCRBV7S3A2A0A539 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCRBV7S3A2A0A539 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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