Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CEP78Q5JTW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms