Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHODHQ02127 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms