Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMC1P11047 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms