Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C5orf58C9J3I9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C5orf58C9J3I9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms