Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf4Q9NR00 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf4Q9NR00 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms