Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VSTM1Q6UX27 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms