Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDLIM3Q53GG5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDLIM3Q53GG5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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