Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ME3Q16798 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ME3Q16798 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ME3Q16798 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME3Q16798 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME3Q16798 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ME3Q16798 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ME3Q16798 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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