Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RASGEF1BQ0VAM2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms