Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP2P81877 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms