Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC4C-201ENST00000278198 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PHC1-201ENST00000433083 5033 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF2-202ENST00000611463 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP2-220ENST00000622681 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF11-203ENST00000396941 2402 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS1-201ENST00000318312 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ECE2-204ENST00000402825 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K3-208ENST00000579585 3352 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA1-201ENST00000378105 4069 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UBASH3A-202ENST00000319294 2504 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC8-201ENST00000302539 4923 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PSAPL1-201ENST00000319098 4680 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MPO-201ENST00000225275 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POU6F1-201ENST00000333640 2960 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRF4-201ENST00000283303 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4B1-214ENST00000614163 1534 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF26-207ENST00000619748 2933 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA4-201ENST00000571252 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM16-211ENST00000577886 1979 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CNFN-201ENST00000222032 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM2-202ENST00000317668 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRM3-201ENST00000327157 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-204ENST00000348259 661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-7P-201ENST00000364105 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LCN1-202ENST00000371781 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C5orf56-202ENST00000378947 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA7.3-201ENST00000384186 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms