Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LIN28AQ9H9Z2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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