Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-11■■□□□ 13
SND1Q7KZF4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.341e-8■■□□□ 13
SND1Q7KZF4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 13
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SND1Q7KZF4 TMX1-203ENST00000556683 2117 ntTSL 216.33■□□□□ 0.21e-8■■□□□ 13
SND1Q7KZF4 SLC35B1-204ENST00000502406 1477 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 13
SND1Q7KZF4 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 13
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