RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.71■■■■■ 4.43
TMX1-202ENST00000555574 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.38■■■■□ 3.73
TMX1-202ENST00000555574 ABCC9O60706 1549 aa38.32■■■■□ 3.72
TMX1-202ENST00000555574 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.48■■■■□ 3.43
TMX1-202ENST00000555574 NACADO15069 1562 aa36.22■■■■□ 3.39
TMX1-202ENST00000555574 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.97■■■■□ 3.35
TMX1-202ENST00000555574 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.86■■■■□ 3.33
TMX1-202ENST00000555574 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.75■■■■□ 3.31
TMX1-202ENST00000555574 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.72■■■■□ 3.31
TMX1-202ENST00000555574 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.63■■■■□ 3.29
TMX1-202ENST00000555574 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.43■■■■□ 3.26
TMX1-202ENST00000555574 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
TMX1-202ENST00000555574 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.27■■■■□ 3.24
TMX1-202ENST00000555574 SCRIBQ14160 1630 aa34.99■■■■□ 3.19
TMX1-202ENST00000555574 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.93■■■■□ 3.18
TMX1-202ENST00000555574 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.63■■■■□ 3.13
TMX1-202ENST00000555574 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
TMX1-202ENST00000555574 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.5■■■■□ 3.11
TMX1-202ENST00000555574 NCAPD3P42695 1498 aa33.41■■■□□ 2.94
TMX1-202ENST00000555574 SMARCA4P51532 1647 aa33.35■■■□□ 2.93
TMX1-202ENST00000555574 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.33■■■□□ 2.93
TMX1-202ENST00000555574 SMARCA2P51531 1590 aa33.26■■■□□ 2.91
TMX1-202ENST00000555574 HMGXB3Q12766 1538 aa33.22■■■□□ 2.91
TMX1-202ENST00000555574 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
TMX1-202ENST00000555574 ERCC6Q03468 1493 aa33.08■■■□□ 2.89
TMX1-202ENST00000555574 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
TMX1-202ENST00000555574 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.01■■■□□ 2.88
TMX1-202ENST00000555574 CUX2O14529 1486 aa32.99■■■□□ 2.87
TMX1-202ENST00000555574 NESP48681 1621 aa32.93■■■□□ 2.86
TMX1-202ENST00000555574 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.92■■■□□ 2.86
TMX1-202ENST00000555574 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.88■■■□□ 2.85
TMX1-202ENST00000555574 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.7■■■□□ 2.82
TMX1-202ENST00000555574 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
TMX1-202ENST00000555574 WIZO95785 1651 aa32.56■■■□□ 2.8
TMX1-202ENST00000555574 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.56■■■□□ 2.8
TMX1-202ENST00000555574 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.46■■■□□ 2.79
TMX1-202ENST00000555574 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.38■■■□□ 2.77
TMX1-202ENST00000555574 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.23■■■□□ 2.75
TMX1-202ENST00000555574 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
TMX1-202ENST00000555574 WDR62O43379 1518 aa32.16■■■□□ 2.74
TMX1-202ENST00000555574 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TMX1-202ENST00000555574 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.1■■■□□ 2.73
TMX1-202ENST00000555574 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.06■■■□□ 2.72
TMX1-202ENST00000555574 CFTRP13569 1480 aa32.04■■■□□ 2.72
TMX1-202ENST00000555574 PRDM2Q13029 1718 aa31.85■■■□□ 2.69
TMX1-202ENST00000555574 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
TMX1-202ENST00000555574 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.74■■■□□ 2.67
TMX1-202ENST00000555574 TRIM41Q8WV44 630 aa31.49■■■□□ 2.63
TMX1-202ENST00000555574 TOPBP1Q92547 1522 aa31.47■■■□□ 2.63
TMX1-202ENST00000555574 IFT140Q96RY7 1462 aa31.44■■■□□ 2.62
TMX1-202ENST00000555574 OSCARQ8IYS5 282 aa31.42■■■□□ 2.62
TMX1-202ENST00000555574 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
TMX1-202ENST00000555574 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.37■■■□□ 2.61
TMX1-202ENST00000555574 ABCC8Q09428 1581 aa31.35■■■□□ 2.61
TMX1-202ENST00000555574 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
TMX1-202ENST00000555574 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
TMX1-202ENST00000555574 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TMX1-202ENST00000555574 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
TMX1-202ENST00000555574 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
TMX1-202ENST00000555574 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
TMX1-202ENST00000555574 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.574e-9■■■■□ 21.5
TMX1-202ENST00000555574 CHD1O14646 1710 aa31.07■■■□□ 2.56
TMX1-202ENST00000555574 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.02■■■□□ 2.56
TMX1-202ENST00000555574 ARHGEF11O15085 1522 aa31.01■■■□□ 2.55
TMX1-202ENST00000555574 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.96■■■□□ 2.55
TMX1-202ENST00000555574 SOGA1O94964 1423 aa30.96■■■□□ 2.55
TMX1-202ENST00000555574 CUX1P39880 1505 aa30.94■■■□□ 2.54
TMX1-202ENST00000555574 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
TMX1-202ENST00000555574 WDR97A6NE52 1622 aa30.87■■■□□ 2.53
TMX1-202ENST00000555574 FBLN2P98095 1184 aa30.86■■■□□ 2.53
TMX1-202ENST00000555574 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.82■■■□□ 2.53
TMX1-202ENST00000555574 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
TMX1-202ENST00000555574 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
TMX1-202ENST00000555574 GRIN2BQ13224 1484 aa30.71■■■□□ 2.51
TMX1-202ENST00000555574 ARAP1Q96P48 1450 aa30.71■■■□□ 2.51
TMX1-202ENST00000555574 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.7■■■□□ 2.51
TMX1-202ENST00000555574 PBRM1Q86U86 1689 aa30.68■■■□□ 2.5
TMX1-202ENST00000555574 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.68■■■□□ 2.5
TMX1-202ENST00000555574 SYNJ1O43426 1573 aa30.64■■■□□ 2.5
TMX1-202ENST00000555574 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
TMX1-202ENST00000555574 SYNJ2O15056 1496 aa30.63■■■□□ 2.49
TMX1-202ENST00000555574 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.61■■■□□ 2.49
TMX1-202ENST00000555574 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.6■■■□□ 2.49
TMX1-202ENST00000555574 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.59■■■□□ 2.49
TMX1-202ENST00000555574 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.48■■■□□ 2.47
TMX1-202ENST00000555574 TOP2BQ02880 1626 aa30.46■■■□□ 2.47
TMX1-202ENST00000555574 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
TMX1-202ENST00000555574 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TMX1-202ENST00000555574 ADAMTS12P58397 1594 aa30.37■■■□□ 2.45
TMX1-202ENST00000555574 GRIN2AQ12879 1464 aa30.33■■■□□ 2.45
TMX1-202ENST00000555574 CEP170Q5SW79 1584 aa30.26■■■□□ 2.43
TMX1-202ENST00000555574 NUP160Q12769 1436 aa30.22■■■□□ 2.43
TMX1-202ENST00000555574 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
TMX1-202ENST00000555574 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.22■■■□□ 2.43
TMX1-202ENST00000555574 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.2■■■□□ 2.43
TMX1-202ENST00000555574 SHROOM2Q13796 1616 aa30.13■■■□□ 2.41
TMX1-202ENST00000555574 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.95■■■□□ 2.38
TMX1-202ENST00000555574 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TMX1-202ENST00000555574 JPH4Q96JJ6 628 aa29.84■■■□□ 2.37
TMX1-202ENST00000555574 CUL7Q14999 1698 aa29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms