RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487766.1

GGT1-226, Transcript of gamma-glutamyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GGT1, Length 638 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGT1-226ENST00000487766 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.08■■■■■ 5.93
GGT1-226ENST00000487766 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.61■■■■■ 5.05
GGT1-226ENST00000487766 ABCC9O60706 1549 aa45.72■■■■■ 4.91
GGT1-226ENST00000487766 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.9■■■■■ 4.62
GGT1-226ENST00000487766 NACADO15069 1562 aa43.76■■■■■ 4.6
GGT1-226ENST00000487766 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.43■■■■■ 4.54
GGT1-226ENST00000487766 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
GGT1-226ENST00000487766 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.26■■■■■ 4.52
GGT1-226ENST00000487766 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.13■■■■■ 4.5
GGT1-226ENST00000487766 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.08■■■■■ 4.49
GGT1-226ENST00000487766 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.68■■■■■ 4.42
GGT1-226ENST00000487766 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
GGT1-226ENST00000487766 SCRIBQ14160 1630 aa42.41■■■■■ 4.38
GGT1-226ENST00000487766 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
GGT1-226ENST00000487766 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.17■■■■■ 4.34
GGT1-226ENST00000487766 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
GGT1-226ENST00000487766 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.43■■■■■ 4.22
GGT1-226ENST00000487766 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.11■■■■■ 4.17
GGT1-226ENST00000487766 SMARCA4P51532 1647 aa40.56■■■■■ 4.08
GGT1-226ENST00000487766 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
GGT1-226ENST00000487766 NCAPD3P42695 1498 aa40.33■■■■■ 4.05
GGT1-226ENST00000487766 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.32■■■■■ 4.05
GGT1-226ENST00000487766 SMARCA2P51531 1590 aa40.29■■■■■ 4.04
GGT1-226ENST00000487766 HMGXB3Q12766 1538 aa40.22■■■■■ 4.03
GGT1-226ENST00000487766 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.19■■■■■ 4.02
GGT1-226ENST00000487766 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.14■■■■■ 4.02
GGT1-226ENST00000487766 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
GGT1-226ENST00000487766 WIZO95785 1651 aa39.73■■■■□ 3.95
GGT1-226ENST00000487766 NESP48681 1621 aa39.51■■■■□ 3.91
GGT1-226ENST00000487766 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
GGT1-226ENST00000487766 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.4■■■■□ 3.9
GGT1-226ENST00000487766 ERCC6Q03468 1493 aa39.39■■■■□ 3.9
GGT1-226ENST00000487766 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
GGT1-226ENST00000487766 CUX2O14529 1486 aa39.18■■■■□ 3.86
GGT1-226ENST00000487766 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.16■■■■□ 3.86
GGT1-226ENST00000487766 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
GGT1-226ENST00000487766 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.07■■■■□ 3.84
GGT1-226ENST00000487766 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39■■■■□ 3.83
GGT1-226ENST00000487766 CFTRP13569 1480 aa38.86■■■■□ 3.81
GGT1-226ENST00000487766 PRDM2Q13029 1718 aa38.76■■■■□ 3.8
GGT1-226ENST00000487766 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
GGT1-226ENST00000487766 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.73■■■■□ 3.79
GGT1-226ENST00000487766 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.7■■■■□ 3.79
GGT1-226ENST00000487766 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.7■■■■□ 3.79
GGT1-226ENST00000487766 WDR62O43379 1518 aa38.69■■■■□ 3.78
GGT1-226ENST00000487766 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
GGT1-226ENST00000487766 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.19■■■■□ 3.7
GGT1-226ENST00000487766 TOPBP1Q92547 1522 aa38.08■■■■□ 3.69
GGT1-226ENST00000487766 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.05■■■■□ 3.68
GGT1-226ENST00000487766 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
GGT1-226ENST00000487766 ABCC8Q09428 1581 aa37.97■■■■□ 3.67
GGT1-226ENST00000487766 IFT140Q96RY7 1462 aa37.88■■■■□ 3.65
GGT1-226ENST00000487766 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
GGT1-226ENST00000487766 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
GGT1-226ENST00000487766 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
GGT1-226ENST00000487766 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
GGT1-226ENST00000487766 CUX1P39880 1505 aa37.7■■■■□ 3.63
GGT1-226ENST00000487766 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.59■■■■□ 3.61
GGT1-226ENST00000487766 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.52■■■■□ 3.6
GGT1-226ENST00000487766 WDR97A6NE52 1622 aa37.49■■■■□ 3.59
GGT1-226ENST00000487766 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
GGT1-226ENST00000487766 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.43■■■■□ 3.58
GGT1-226ENST00000487766 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.36■■■■□ 3.57
GGT1-226ENST00000487766 CHD1O14646 1710 aa37.32■■■■□ 3.56
GGT1-226ENST00000487766 SYNJ1O43426 1573 aa37.3■■■■□ 3.56
GGT1-226ENST00000487766 TOP2BQ02880 1626 aa37.3■■■■□ 3.56
GGT1-226ENST00000487766 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
GGT1-226ENST00000487766 OSCARQ8IYS5 282 aa37.25■■■■□ 3.55
GGT1-226ENST00000487766 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.23■■■■□ 3.55
GGT1-226ENST00000487766 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.21■■■■□ 3.55
GGT1-226ENST00000487766 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.21■■■■□ 3.55
GGT1-226ENST00000487766 PBRM1Q86U86 1689 aa37.21■■■■□ 3.55
GGT1-226ENST00000487766 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.16■■■■□ 3.54
GGT1-226ENST00000487766 GRIN2BQ13224 1484 aa37.13■■■■□ 3.53
GGT1-226ENST00000487766 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
GGT1-226ENST00000487766 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.07■■■■□ 3.52
GGT1-226ENST00000487766 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
GGT1-226ENST00000487766 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
GGT1-226ENST00000487766 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.99■■■■□ 3.51
GGT1-226ENST00000487766 SYNJ2O15056 1496 aa36.94■■■■□ 3.5
GGT1-226ENST00000487766 ARHGEF11O15085 1522 aa36.91■■■■□ 3.5
GGT1-226ENST00000487766 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.9■■■■□ 3.5
GGT1-226ENST00000487766 ADAMTS12P58397 1594 aa36.87■■■■□ 3.49
GGT1-226ENST00000487766 FBLN2P98095 1184 aa36.86■■■■□ 3.49
GGT1-226ENST00000487766 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.77■■■■□ 3.48
GGT1-226ENST00000487766 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
GGT1-226ENST00000487766 TRIM41Q8WV44 630 aa36.73■■■■□ 3.47
GGT1-226ENST00000487766 GRIN2AQ12879 1464 aa36.69■■■■□ 3.46
GGT1-226ENST00000487766 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.62■■■■□ 3.45
GGT1-226ENST00000487766 ARAP1Q96P48 1450 aa36.61■■■■□ 3.45
GGT1-226ENST00000487766 CEP170Q5SW79 1584 aa36.6■■■■□ 3.45
GGT1-226ENST00000487766 NUP160Q12769 1436 aa36.55■■■■□ 3.44
GGT1-226ENST00000487766 KIF27Q86VH2 1401 aa36.44■■■■□ 3.42
GGT1-226ENST00000487766 CUL7Q14999 1698 aa36.44■■■■□ 3.42
GGT1-226ENST00000487766 SHROOM2Q13796 1616 aa36.42■■■■□ 3.42
GGT1-226ENST00000487766 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.36■■■■□ 3.41
GGT1-226ENST00000487766 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.32■■■■□ 3.41
GGT1-226ENST00000487766 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.32■■■■□ 3.4
GGT1-226ENST00000487766 IGF1RP08069 1367 aa36.3■■■■□ 3.4
GGT1-226ENST00000487766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms