Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM25Q14258 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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