Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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CASQ1P31415 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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CASQ1P31415 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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CASQ1P31415 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CASQ1P31415 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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CASQ1P31415 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CASQ1P31415 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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