Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPO95166 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms