Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TVP23AA6NH52 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TVP23AA6NH52 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms