Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BATF3Q9NR55 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms