Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BATF3Q9NR55 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BATF3Q9NR55 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
BATF3Q9NR55 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BATF3Q9NR55 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BATF3Q9NR55 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BATF3Q9NR55 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BATF3Q9NR55 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BATF3Q9NR55 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
BATF3Q9NR55 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BATF3Q9NR55 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BATF3Q9NR55 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BATF3Q9NR55 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BATF3Q9NR55 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BATF3Q9NR55 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BATF3Q9NR55 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BATF3Q9NR55 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BATF3Q9NR55 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BATF3Q9NR55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BATF3Q9NR55 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BATF3Q9NR55 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BATF3Q9NR55 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BATF3Q9NR55 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BATF3Q9NR55 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BATF3Q9NR55 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BATF3Q9NR55 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BATF3Q9NR55 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BATF3Q9NR55 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BATF3Q9NR55 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BATF3Q9NR55 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BATF3Q9NR55 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BATF3Q9NR55 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BATF3Q9NR55 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BATF3Q9NR55 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BATF3Q9NR55 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BATF3Q9NR55 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BATF3Q9NR55 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BATF3Q9NR55 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BATF3Q9NR55 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BATF3Q9NR55 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BATF3Q9NR55 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BATF3Q9NR55 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BATF3Q9NR55 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BATF3Q9NR55 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BATF3Q9NR55 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BATF3Q9NR55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BATF3Q9NR55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BATF3Q9NR55 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BATF3Q9NR55 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BATF3Q9NR55 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BATF3Q9NR55 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BATF3Q9NR55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BATF3Q9NR55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BATF3Q9NR55 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BATF3Q9NR55 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BATF3Q9NR55 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BATF3Q9NR55 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BATF3Q9NR55 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BATF3Q9NR55 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BATF3Q9NR55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BATF3Q9NR55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BATF3Q9NR55 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BATF3Q9NR55 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BATF3Q9NR55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BATF3Q9NR55 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BATF3Q9NR55 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BATF3Q9NR55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BATF3Q9NR55 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BATF3Q9NR55 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BATF3Q9NR55 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BATF3Q9NR55 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BATF3Q9NR55 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BATF3Q9NR55 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BATF3Q9NR55 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BATF3Q9NR55 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BATF3Q9NR55 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BATF3Q9NR55 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BATF3Q9NR55 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BATF3Q9NR55 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BATF3Q9NR55 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BATF3Q9NR55 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BATF3Q9NR55 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BATF3Q9NR55 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BATF3Q9NR55 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BATF3Q9NR55 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BATF3Q9NR55 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BATF3Q9NR55 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms