Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BIN3Q9NQY0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms