Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
OPALINQ96PE5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms