Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSMEM1Q8WWF3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms