Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTROBQ8N137 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms