Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALB2P22676 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALB2P22676 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALB2P22676 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALB2P22676 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALB2P22676 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms