Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC3P02656 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms