Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
APOC3P02656 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOC3P02656 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APOC3P02656 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOC3P02656 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOC3P02656 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOC3P02656 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOC3P02656 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
APOC3P02656 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOC3P02656 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOC3P02656 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOC3P02656 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOC3P02656 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOC3P02656 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOC3P02656 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOC3P02656 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APOC3P02656 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOC3P02656 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOC3P02656 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOC3P02656 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOC3P02656 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APOC3P02656 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC3P02656 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APOC3P02656 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOC3P02656 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC3P02656 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOC3P02656 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOC3P02656 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOC3P02656 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC3P02656 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC3P02656 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC3P02656 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC3P02656 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC3P02656 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC3P02656 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC3P02656 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC3P02656 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC3P02656 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOC3P02656 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC3P02656 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC3P02656 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOC3P02656 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOC3P02656 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC3P02656 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOC3P02656 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOC3P02656 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOC3P02656 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOC3P02656 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOC3P02656 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOC3P02656 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOC3P02656 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOC3P02656 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOC3P02656 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOC3P02656 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOC3P02656 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC3P02656 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC3P02656 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC3P02656 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC3P02656 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APOC3P02656 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APOC3P02656 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOC3P02656 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOC3P02656 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOC3P02656 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOC3P02656 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC3P02656 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC3P02656 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC3P02656 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOC3P02656 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOC3P02656 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOC3P02656 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APOC3P02656 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APOC3P02656 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC3P02656 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOC3P02656 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC3P02656 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC3P02656 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOC3P02656 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC3P02656 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC3P02656 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC3P02656 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APOC3P02656 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC3P02656 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APOC3P02656 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC3P02656 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC3P02656 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC3P02656 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOC3P02656 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC3P02656 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC3P02656 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC3P02656 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC3P02656 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC3P02656 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOC3P02656 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC3P02656 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC3P02656 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC3P02656 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC3P02656 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC3P02656 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOC3P02656 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms