Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRMUO75648 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRMUO75648 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMUO75648 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMUO75648 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRMUO75648 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms