Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF316A6NFI3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms