Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPASTQ9UBP0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms