Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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SMIM20Q8N5G0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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SMIM20Q8N5G0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SMIM20Q8N5G0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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