Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT80Q6KB66 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms