Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.235e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-214ENST00000528652 519 ntTSL 321.47■■□□□ 1.032e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-208ENST00000525003 544 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 416.47■□□□□ 0.231e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 520.21■□□□□ 0.836e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 417.07■□□□□ 0.326e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 216.73■□□□□ 0.276e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMEM132D-AS1-203ENST00000512133 2271 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.061e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.961e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.622e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.632e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.642e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.692e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.532e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 329.26■■■□□ 2.277e-15■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.877e-15■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 REPIN1-216ENST00000518462 621 ntTSL 420.01■□□□□ 0.797e-15■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.787e-15■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 417.17■□□□□ 0.347e-15■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 514.39□□□□□ -0.117e-15■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 SLC16A3-209ENST00000580098 859 ntTSL 221.76■■□□□ 1.078e-9■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 SLC16A3-210ENST00000580189 872 ntTSL 521.37■■□□□ 1.018e-9■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 SLC16A3-217ENST00000583237 808 ntTSL 320.28■□□□□ 0.848e-9■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.542e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.382e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-7■■■□□ 15.2
PCBP1Q15365 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 PIM2-203ENST00000485431 711 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.831e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.195e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 POFUT1-203ENST00000434904 493 ntTSL 54.78□□□□□ -1.645e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.443e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.353e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 RNF10-213ENST00000539486 321 ntTSL 415.73■□□□□ 0.117e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 RNF10-216ENST00000542438 562 ntTSL 415.09■□□□□ 0.017e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.597e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.671e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CIZ1-208ENST00000415526 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.681e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CMC1-201ENST00000334841 724 ntTSL 316.6■□□□□ 0.255e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.145e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 DGKZ-218ENST00000529698 792 ntTSL 314.63□□□□□ -0.075e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.565e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CMC1-209ENST00000477739 3749 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.845e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 LINC00534-204ENST00000524361 620 ntTSL 36.82□□□□□ -1.325e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 213.04□□□□□ -0.323e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 211.69□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.593e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.843e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.033e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.033e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.043e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.823e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 412.72□□□□□ -0.379e-8■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 322.97■■□□□ 1.272e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 420.8■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 418.85■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)11.88□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 26.38□□□□□ -1.392e-6■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.181e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.741e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-212ENST00000513975 1464 ntTSL 216.19■□□□□ 0.181e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 15.1
PCBP1Q15365 FIP1L1-205ENST00000505125 3180 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.231e-7■■■□□ 15.1
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