Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBB4BP68371 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBB4BP68371 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms