Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CRIP1P50238 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms