Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCP20941 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCP20941 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCP20941 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCP20941 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCP20941 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCP20941 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCP20941 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCP20941 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms