Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms