Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRR-201ENST00000283228 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MORC1-201ENST00000232603 3764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRP4-202ENST00000426920 2650 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CSPG4P10-202ENST00000612093 3411 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TOPORS-201ENST00000360538 4098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01660-204ENST00000619172 3572 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AACSP1-201ENST00000503486 2822 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 GLYR1-202ENST00000436648 3466 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR155-202ENST00000392551 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FP565260.7-201ENST00000623998 3634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 EAF1-201ENST00000396842 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 DLGAP1-218ENST00000581527 3525 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TNFAIP3-201ENST00000237289 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC025279.1-201ENST00000604430 4818 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 EPB41L4A-211ENST00000621003 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC098679.1-201ENST00000503611 2917 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 VAC14-AS1-202ENST00000562507 4853 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC104825.2-201ENST00000505448 3249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HIF3A-205ENST00000377670 5852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 SIN3A-208ENST00000567289 4078 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.2 ms