Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms