Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KIFAP3Q92845 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms