Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAN2C1-204ENST00000561693 1152 ntTSL 516.48■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.238e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 316.38■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MOB2-206ENST00000531976 3174 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.178e-10■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 C8orf33-202ENST00000524395 1125 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MGAT1-209ENST00000505682 534 ntTSL 316.05■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 C8orf33-204ENST00000530455 2676 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TBCD-208ENST00000572389 776 ntTSL 215.51■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SF3A2-203ENST00000587637 501 ntTSL 215.21■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TBCD-223ENST00000576691 929 ntTSL 315.13■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TACC3-205ENST00000467746 966 ntTSL 315.09■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 VPS51-216ENST00000534591 1503 ntTSL 514.97□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 VPS51-203ENST00000526856 691 ntTSL 214.86□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 C8orf33-205ENST00000534350 1329 ntTSL 414.73□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-209ENST00000441879 724 ntTSL 314.66□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 414.13□□□□□ -0.158e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TBCD-220ENST00000576432 684 ntTSL 213.82□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 313.77□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NCAPH2-206ENST00000518394 720 ntTSL 513.67□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAN2C1-233ENST00000566569 848 ntTSL 513.5□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-204ENST00000416579 895 ntTSL 313.42□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 FLOT2-209ENST00000584569 266 ntTSL 313.41□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SDCCAG8-210ENST00000496361 947 ntTSL 213.41□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ABCA2-219ENST00000488535 3327 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TRAF7-204ENST00000567645 737 ntTSL 513.27□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TACC3-211ENST00000493975 825 ntTSL 313.14□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAN2C1-213ENST00000563528 367 ntTSL 313.14□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-202ENST00000411591 1084 ntTSL 313.13□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 FAM171A2-203ENST00000589407 1066 ntTSL 312.64□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MPND-208ENST00000601877 379 ntTSL 512.59□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 TACC3-203ENST00000458173 778 ntTSL 512.4□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 MAN2C1-205ENST00000562067 710 ntTSL 512.38□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.518e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 MOB2-202ENST00000526462 795 ntTSL 211.73□□□□□ -0.538e-10■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.548e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-214ENST00000473978 1430 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 FAM102A-206ENST00000493175 423 ntTSL 311.61□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 32.7
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SF3B4Q15427 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 AP4M1-212ENST00000450807 548 ntTSL 311□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-211ENST00000474528 4072 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CPNE2-203ENST00000565766 844 ntTSL 510.59□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ANKHD1-208ENST00000421706 801 ntTSL 210.52□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.748e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-207ENST00000461352 3578 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAP4K4-217ENST00000496989 574 ntTSL 410.35□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ERGIC1-203ENST00000518247 554 ntTSL 410.3□□□□□ -0.768e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CTC1-206ENST00000579066 514 ntTSL 310.19□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.838e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 IL6ST-206ENST00000381298 9057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 MAP4K4-213ENST00000476609 3598 ntTSL 29.79□□□□□ -0.841e-13■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-218ENST00000487508 507 ntTSL 49.79□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-205ENST00000442582 489 ntTSL 39.71□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CPNE2-206ENST00000566042 3446 ntTSL 29.67□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-208ENST00000463277 575 ntTSL 49.52□□□□□ -0.898e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 RUBCN-203ENST00000413360 3801 ntTSL 58.91□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 PCYT1A-205ENST00000430755 798 ntTSL 38.9□□□□□ -0.988e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SDCCAG8-205ENST00000476722 1871 ntTSL 38.77□□□□□ -1.018e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 GRHPR-205ENST00000482603 597 ntTSL 38.63□□□□□ -1.037e-11■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 LTK-206ENST00000569283 582 ntTSL 38.61□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 RBSN-208ENST00000483098 532 ntTSL 48.54□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ANKHD1-EIF4EBP3-201ENST00000437495 2243 ntTSL 58.27□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ANKHD1-210ENST00000432301 3234 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.158e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 SFXN5-209ENST00000464825 532 ntTSL 47.6□□□□□ -1.198e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 KLHL42-203ENST00000540301 793 ntTSL 37.52□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 CCT2-214ENST00000553169 758 ntTSL 27.23□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 32.7
SF3B4Q15427 ANKHD1-211ENST00000433049 3649 ntTSL 56.77□□□□□ -1.328e-7■■■■■ 32.7
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