Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAPTM4AQ15012 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms