Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ALCAMQ13740 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALCAMQ13740 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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