Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRG2P13727 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRG2P13727 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRG2P13727 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRG2P13727 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms