Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
J3KT08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
J3KT08 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
J3KT08 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms