Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPDC1A2A3K4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms