Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NICN1Q9BSH3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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