Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF628Q5EBL2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF628Q5EBL2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms